Fmoc-Gly-Gly-OH는 Fmoc로 보호된 글리신 잔기가 아미드 결합을 통해 두 번째 글리신에 결합되어 구조식 Fmoc-NH-CH2-CO-NH-CH2-COOH를 생성하는 디펩티드 유도체입니다. 글리신은 비키랄이므로 분자에는 키랄 중심이 없습니다. 디펩티드 백본은 매우 유연하므로 Fmoc-Gly-Gly-OH는 펩티드 기반 링커를 구성하는 데 이상적인 빌딩 블록입니다.
Fmoc-Asp(OtBu)-OH는 측쇄 β-카르복실 그룹에 tert-부틸(OtBu) 보호 그룹이 있는 Fmoc 보호 L-아스파르트산 유도체입니다. 구조적으로, 분자는 9-플루오레닐메톡시카르보닐(Fmoc) 그룹(고체상 펩타이드 합성(SPPS)을 위한 표준 염기 불안정 보호 그룹)으로 보호된 1차 아민과 tert-부틸 에스테르로 보호된 측쇄 카르복실산이 있는 L-아스파르트산 코어로 구성됩니다.
Fmoc-D-Leu-OH(N-[(9H-플루오렌-9-일메톡시)카르보닐]-D-류신)은 필수 분지쇄 아미노산 L-류신의 비천연 거울상이성질체인 D-류신의 N-Fmoc 보호된 형태입니다. 분자 구조는 D-류신의 α-아미노 그룹에 부착된 9-플루오레닐메틸옥시카보닐(Fmoc) 그룹을 특징으로 하며, 카르복실산은 펩티드 결합 형성을 위해 자유롭게 남아 있습니다.
Fmoc-Dab(Boc)-OH(N-[(9H-플루오렌-9-일메톡시)카르보닐]-N'-tert-부톡시카르보닐-L-2,4-디아미노부티르산)은 비단백질성 아미노산 L-2,4-디아미노부티르산(Dab)의 직교 보호된 유도체입니다. 구조는 α-아민을 보호하는 염기 불안정성 9-플루오레닐메틸옥시카르보닐(Fmoc) 그룹과 γ-아민 측쇄를 보호하는 산 불안정성 tert-부톡시카르보닐(Boc) 그룹으로 구성됩니다. 이 직교 보호 체계(α-아민의 Fmoc 및 γ-아민의 Boc)는 단일 아미노산 빌딩 블록 내 두 개의 서로 다른 아민 위치의 선택적, 순차적 탈보호 및 기능화를 가능하게 합니다.
Fmoc-Thi-OH는 측쇄로 티오펜 헤테로사이클을 특징으로 하는 Fmoc로 보호된 비천연 아미노산입니다. 구조적으로, 분자는 α-아미노 작용기를 보호하는 플루오레닐메틸옥시카르보닐(Fmoc) 그룹, 중앙 알라닌 유래 키랄 중심 및 β-위치의 2-티에닐 그룹으로 구성됩니다. 티오펜 고리는 페닐알라닌 벤젠 고리의 황 함유 방향족 생물학적 동배체 역할을 하며 유사한 전자 특성을 제공하지만 뚜렷한 분극성과 수소 결합 특성을 제공합니다.
Fmoc-Asn(Trt)-OH는 고체상 펩타이드 합성을 위해 특별히 설계된 완전히 보호된 L-아스파라긴 유도체입니다. α-아미노 그룹은 사슬 연장 제어를 위해 Fmoc 그룹으로 보호되는 반면, 아스파라긴의 아미드 측쇄는 트리틸(트리페닐메틸, Trt) 그룹으로 보호됩니다. 이러한 직교 보호 전략은 아스파라긴의 비치환 측쇄 아미드가 펩타이드 조립 중 시아노알라닌으로의 탈수를 포함하여 바람직하지 않은 부작용을 겪을 수 있기 때문에 아스파라긴에 매우 중요합니다.