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Bz-rC 포스포라미다이트
  • Bz-rC 포스포라미다이트Bz-rC 포스포라미다이트

Bz-rC 포스포라미다이트

Model: 118380-84-0
Bz-rC 포스포라미다이트(DMT-2'-O-TBDMS-rC(Bz) 포스포라미다이트, CAS 118380-84-0이라고도 함)는 고체상 RNA 합성에 사용되는 표준 리보뉴클레오시드 포스포라미다이트 단량체입니다. 이 분자는 리보스 당의 2'-O-TBDMS(tert-부틸디메틸실릴) 보호 그룹, 시토신 염기의 N4-벤조일(Bz) 고리외 아민 보호 그룹, 5'-하이드록실 위치의 5'-O-디메톡시트리틸(DMT) 보호 그룹, 3' 위치의 β-시아노에틸(CE) 포스포르아미다이트 기능을 특징으로 합니다. N4-벤조일 그룹은 시토신 고리외 아민에 대해 가장 널리 사용되는 보호 전략 중 하나이며, 올리고뉴클레오티드 사슬 조립 중 원하지 않는 아실화 및 분기 반응에 대한 강력한 보호 기능을 제공합니다. 2'-O-TBDMS 그룹은 RNA 합성에서 2'-하이드록실에 대한 고전적인 보호 그룹으로, 탈보호 중 탁월한 선택성과 표준 고체상 합성 주기와의 호환성을 제공합니다. Bz-rC Phosphoramidite는 구조 생물학에서 RNA 치료에 이르기까지 다양한 응용 분야를 위해 시티딘 잔기를 합성 RNA 올리고뉴클레오티드에 정확하게 통합해야 하는 연구자가 선택하는 빌딩 블록입니다.

Bz-rC 포스포라미다이트는 RNA 올리고뉴클레오티드의 화학적 합성을 위한 기본 단량체입니다. 시토신 염기의 N4-벤조일 보호 그룹은 포스포라미다이트 결합 주기 동안 분기 및 사슬 종결을 방지하는 반면, 2'-O-TBDMS 그룹은 사슬 조립 전체에서 2'-히드록실을 보호하고 트리에틸아민 삼불화수소(TEA·3HF)와 같은 불소 기반 시약을 사용하여 합성 후에 제거됩니다. Bz-rC Phosphoramidite는 자동화된 DNA/RNA 합성기(예: Applied Biosystems, MerMade, Dr. Oligo)의 표준 RNA 합성 프로토콜과 호환되며 일반적으로 0.25M 활성제 용액(5-에틸티오-1H-테트라졸, 4,5-디시아노이미다졸)을 사용하고 결합 시간은 5~10분입니다. Bz-rC 포스포라미다이트는 구조 연구, 안티센스 올리고뉴클레오티드, siRNA 및 앱타머를 위한 RNA 합성에서 광범위하게 검증되었습니다. Bz-rC 포스포라미다이트는 올리고뉴클레오티드 불순물 프로파일링에서 참조 표준으로도 사용됩니다. 벤조일 그룹이 공정 개발 중에 모니터링해야 하는 특징적인 부산물(예: N4-벤조일-탈피리미딘화 생성물)을 생성할 수 있기 때문입니다.


제품 매개변수

매개변수

사양

제품명

Bz-rC 포스포라미다이트

CAS 번호

118380-84-0

분자식

C₅₂H₆₆N₅O₉PSi

분자량

976.17g/몰

순도(HPLC)

≥98%(일반적인 공급업체 사양)

물리적 형태

단단한

모습

백색 내지 회백색 분말

보관 온도

2~8℃

pKa

8.55±0.20(예상)


코스퍼팜의 품질보증

각 배치는 다음을 수행합니다.

● 가스 크로마토그래피(GC) – 순도 ≥97.0%

● 비수성 적정 – 순도 ≥97.0%

● 굴절률 – 확증적 분석

● ¹H NMR – 구조 검증

● 성상 – 무색~연황색~연황색의 투명한 액체

모든 배송에는 포괄적인 COA, MSDS(전체 GHS 정보 포함) 및 원산지 증명서가 함께 제공됩니다.


FAQ

Q1: Bz-rC 포스포라미다이트와 Ac-rC 포스포라미다이트의 차이점은 무엇입니까?

A: Bz-rC 포스포라미다이트는 시토신의 N4 외소고리 아민에 벤조일(Bz) 보호 그룹을 사용하는 반면, Ac-rC는 아세틸(Ac) 그룹을 사용합니다. 벤조일 그룹은 DMT 제거의 산성 조건(디클로로메탄 중 3% 트리클로로아세트산)에서 탈피리미딘화에 대해 더 큰 보호를 제공합니다. 대부분의 RNA 합성 응용 분야에서 길거나 데옥시시티딘이 풍부한 서열에는 벤조일 그룹이 선호됩니다.

Q2: 표준 합성기에서 Bz-rC Phosphoramidite에 권장되는 결합 시간은 얼마입니까?

A: 0.25M 활성화제(예: 5-에틸티오-1H-테트라졸 또는 4,5-디시아노이미다졸)를 사용하는 표준 RNA 합성 조건에서 Bz-rC 포스포라미다이트의 일반적인 결합 시간은 5~10분입니다. 더 긴 올리고뉴클레오티드(>40량체) 또는 고처리량 합성의 경우 활성화제 농도와 커플링 시간을 최적화하면 수율이 향상될 수 있습니다.


제품 적용 시나리오

1.RNA 올리고뉴클레오티드 합성

Bz-rC 포스포라미다이트는 연구, 진단 및 치료 개발을 위해 시티딘 잔기를 합성 RNA 올리고뉴클레오티드에 도입하기 위한 표준 빌딩 블록입니다.

2.siRNA 제조

2'-OH 시티딘을 siRNA 이중나선에 통합하는 데 사용됩니다. TBDMS 그룹은 합성 후 제거되어 RNAi 연구를 위한 완전한 천연 RNA를 생성합니다.

3.안티센스 올리고뉴클레오티드(ASO) 합성

RNA 전사물을 표적으로 하는 ASO에는 RNA 세그먼트가 필요합니다(예: gapmer 디자인에서). Bz-rC Phosphoramidite는 2'-OH로 남겨두거나 변형할 때 완전한 뉴클레아제 저항성을 갖는 필수 시티딘 잔기를 공급합니다.

4.RNA 앱타머 생성

압타머 라이브러리와 개별 압타머 후보는 Bz-rC Phosphoramidite를 사용하여 화학적으로 합성되어 서열 충실도와 확장성을 보장합니다.

5.구조 생물학 RNA 준비

X선 결정학 및 NMR 연구를 위해서는 잘 정의된 RNA 서열을 고순도로 합성해야 합니다. Bz-rC 포스포라미다이트는 필요한 결합 효율과 탈보호 청결도를 제공합니다.

6.불순물 프로파일링 기준표준

올리고뉴클레오티드 약물 성분(예: 잔류 N4-벤조일-시티딘, 불완전 탈보호 제품)의 잠재적 공정 불순물인 Bz-rC 포스포라미다이트 또는 탈보호 유도체는 HPLC 및 LC-MS 방법에서 참조 표준으로 사용됩니다.


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